Yeast linear plasmids as a model for poxviral transcription
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202100005
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
21-25504S
Alternative language
Project name in Czech
Lineární plasmidy kvasinek jako model transkripce poxvirů
Annotation in Czech
Při analýze transkriptomu lineárních, cytoplasmaticky lokalizovaných dsDNA plasmidů kvasinek byly překvapivě odhaleny netemplátové poly(A) sekvence na 5' koncích mRNA molekul. Podobné uspořádání mRNA je známo u poxvirů, v čele s virem vakcinie (VACV). Za přidání netemplátové sekvence je v obou případech zodpovědná RNA polymeráza (RNAP) kódovaná těmito cytoplasmatickými elementy. A právě studium RNAP a jejich role v syntéze netemplátových sekvencí a podrobná analýza jednotlivých mRNA molekul VACV, zejména s ohledem na ne zcela jasnou přítomnost 7-methylguanosinové čepičky na 5' koncích VACV mRNA, je prvním z cílů tohoto návrhu. Druhým z cílů je příprava in vitro funkčního transkripčního systému odvozeného od velmi jednoduchého, pouze z dvoupodjednotkové RNAP, capping enzymu a transkripčního faktoru se skládajícího, transkripčního systému lineárních plasmidů kvasinek, který vykazuje značnou podobnost svých základních komponent s poxvirovým transkripčním aparátem. Dalším z důležitých cílů je stanovení 3D struktury tohoto unikátního kvasinkového transkripčního aparátu pomocí cryoEM.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - secondary branch
10607 - Virology
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2021
Realization period - end
Mar 31, 2024
Project status
—
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Mar 12, 2025
Finance
Total approved costs
5,679 thou. CZK
Public financial support
5,679 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK