Zoom in the fish eye & blood: molecular evolution of functional adaptations in the deep-sea and freshwater fishes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202100005
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
21-31712S
Alternative language
Project name in Czech
Oko a krev ryb zblízka: molekulární evoluce adaptací u hlubokomořských a sladkovodních ryb
Annotation in Czech
Ryby se během evoluce úspěšně adaptovaly na různá prostředí. Zrakový systém ryb se přizpůsobil i tak extrémnímu prostředí, jako je hluboké moře. Během molekulární adaptace dochází k mutacím rhodopsinových genů, které následně vedou ke změně funkce proteinu (=posun citlivosti na jinou barvu světla). Navržený projekt navazuje na naše předchozí objevení unikátního zrakového systému u hlubokomořských ryb, který by mohl umožnit barevné vidění pouze za použití tyčinek. Hlavním cílem tohoto projektu je implementace dvou moderních přístupů, 1) in vitro regenerace rhodopsinů za účelem přesného změření jejich citlivosti, a 2) single-cell sekvenování, které umožní rozlišení na úrovni jednotlivých fotoreceptorů a tím test hypotézy o barevném vidění. Projekt dále počítá s hledáním dalších odchylek zraku pomocí celogenomového screeningu napříč skupinami hlubokomořských ryb. Mimo zrak dále plánujeme in-vitro regeneraci a funkční test hlubokovodní varianty hemoglobinu, kterou jsme objevili v našem předchozím výzkumu na cichlidách z kráterových jezer.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - secondary branch
10613 - Zoology
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EA - Morphology and cytology<br>EG - Zoology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2021
Realization period - end
Jun 30, 2024
Project status
—
Latest support payment
Apr 1, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Mar 12, 2025
Finance
Total approved costs
9,953 thou. CZK
Public financial support
9,953 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK