RNA editing in non-model flagellates
Project goals
Armed with new tools to analyze canonical and non-canonical RNA editing at the level of singular events, we will study this process in non-model trypanosomatids and other euglenozoans. In addition, we propose to scrutinize the structure of kinetoplast (k)DNA and spatial localization of kinetoplast DNA maxi- and minicircles in a set of selected flagellates that we have introduced into culture and made amenable to molecular studies. For this, we will use specific probes against maxi- and minicircle sequences combined with immunofluorescence microscopy, and advanced electron microscopy techniques (TEM, SEM, and SBEM-SEM).
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Ostravská univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-01026S
Alternative language
Project name in Czech
Editování RNA u nemodelových bičíkovců
Annotation in Czech
Cílem je studium editování RNA u nemodelových trypanosomatid a dalších euglenozoárních prvoků za použití námi nově vytvořených metod a programů, díky nimž můžeme poprvé analyzovat klasické i neobvyklé editační dráhy s rozlišením jediného nukleotidu. Rovněž se pokusíme objasnit prostorové uspořádání maxikroužků a minikroužků v mitochondriální (kinetoplastové) DNA u vybraných parazitických trypanozom a volně žijících diplonem, které jsme úspěšně vnesli do kultury. K tomuto účelu použijeme imunofluorescenční metody se specifickými probami, včetně pokročilých elektronových metod (TEM, SEM, SBEM-SEM).
Scientific branches
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
—
Latest support payment
Apr 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Mar 12, 2025
Finance
Total approved costs
9,432 thou. CZK
Public financial support
8,906 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
9 432 CZK thou.
Public support
8 906 CZK thou.
0%
Provider
Czech Science Foundation
OECD FORD
Biochemistry and molecular biology
Solution period
01. 01. 2022 - 31. 12. 2024