Comprehensive characterization of histone epigenetic marks
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-28190S
Alternative language
Project name in Czech
Komplexní charakterizace histonových epigenetických značek
Annotation in Czech
Histonové posttranslační modifikace (PTM) jsou základními epigenetickými regulátory genové exprese. Jelikož nerovnováha ve stavu modifikací často vede ke vzniku nemocí, vývoj metod pro detailní charakterizaci histonů má zásadní význam. V současné době jsou přednostně pro analýzu PTM využívány přístupy založené na hmotnostní spektrometrii (MS). K identifikaci histonových značek je většinou používána shotgun proteomická analýza po chemické derivatizaci histonových lysinových zbytků. Tyto analýzy jsou však náročné, hlavně kvůli rozmanitosti histonových variant a jejich modifikací. Cílem projektu je vývoj metodiky pro charakterizaci histonů v savčích i rostlinných systémech. Zaměříme se zejména na zlepšení chromatografických vlastností histonových peptidů volbou nových derivatizačních činidel, štěpení pomocí alternativních proteáz a aplikaci pokročilých metod akvizice MS dat. Zavedené postupy budou sloučeny do komplexního protokolu umožňujícího paralelní charakterizaci více typů histonových PTM.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CB - Analytical chemistry, separation
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2024
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Mar 10, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
6,324 thou. CZK
Public financial support
6,082 thou. CZK
Other public sources
242 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK