Analysis and sampling of molecular simulations by adversarial autoencoders

Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta potravinářské a biochemické technologie
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-29667S

Project name in Czech
Analýza a vzorkování molekulárních simulací pomocí kontradiktorních autokodérů
Annotation in Czech
Podstatné zrychlení molekulárních simulací by umožnilo jejich větší zapojení do projektů vývoje nových léčiv nebo designu proteinů. V současnosti používané algoritmy jsou pomalé kvůli vysokým energetickým barierám mezi různými stavy systému a z důvodů nutnosti použít krátké simulační kroky. Cílem projektu je přispět k řešení tohoto problému s použitím umělých neuronových sítí, konkrétně algoritmu kontradiktorních autokodérů. Tento algoritmus bude použit pro analýzu simulačních trajektorií (redukce dimenze). Následně bude použit ve spojení s metadynamikou pro usnadnění překonávání energetických bariér a výpočet profilu volné energie. Nakonec bude tento algoritmus použit pro vzorkování stavů simulovaného systému s řádově větší efektivitou (větším krokem), než v případě konvenčních simulací.

R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10403 - Physical chemistry
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 20, 2023

Similar projects(10)