Like fish out of water? Elucidating the ecophysiology of upland-soil methanogens through cultivation and omics methods
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202200004
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
22-34650S
Alternative language
Project name in Czech
Jako ryba na suchu? Objasnění ekofyziologie metanogenů z vrchovinných půd pomocí kultivace a omických metod
Annotation in Czech
Metan je silný skleníkový plyn a důležitý zdroj energie. Předpokládalo se, že metanogeneze probíhá pouze v anoxickém prostředí. Nedávné práce však tuto představu zpochybňují tím, že ukazují aktivitu některých metanogenů v oxických prostředích. Kromě toho metanogeny v půdách procházejí cykly vysychání a zvlhčování. Vzhledem k tomu, že metanogeny netvoří spory, jsou jejich mechanismy vyrovnávání se s kyslíkem a vysycháním z velké části neznámé. Mnoho metanogenních kmenů je uloženo ve veřejných sbírkách kultur. Všechny však byly získány z trvale anoxického prostředí. Cílem tohoto projektu je odhalit, jak se metanogeny vyrovnávají s kyslíkem a vysycháním. Práce bude zahrnovat kultivaci nových metanogenů z půd vrchovinných oblastí, srovnávací genomiku s existujícími kmeny s cílem postulovat, které genetické mechanismy se podílejí na výše uvedených procesech tolerance vůči stresu. Následovat budou fyziologické, transkriptomické a proteomické experimenty, které tyto hypotézy potvrdí. Projekt bude mít dopad na základní mikrobiologii, ale bude také důležitý pro biotechnologický průmysl.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10618 - Ecology
OECD FORD - secondary branch
20801 - Environmental biotechnology
OECD FORD - another secondary branch
10606 - Microbiology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology<br>EH - Ecology - communities<br>EI - Biotechnology and bionics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
P - Interrupted multi-year project
Latest support payment
Apr 1, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
7,914 thou. CZK
Public financial support
7,914 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK