Hotspot of inter-kingdom interactions: microbial colonization of Fragilaria crotonensis as a model for community assembly processes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202300001
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-05081S
Alternative language
Project name in Czech
Hotspot mikrobiálních interakcí: kolonizace Fragilaria crotonensis jako model pro poznání procesů utvářejících mnohaúrovňová konsorcia mikroorganismů
Annotation in Czech
Pevná křemičitá schránka rozsivek bývá obalena tenkou slizovou vrstvou („fykosférou“), která je místem intenzivních interakcí mikroorganismů různých evolučních skupin. Hojně rozšířená velká rozsivka Fragilaria crotonensis představuje jedinečný model pro studium mechanismů utváření mnohaúrovňových konsorcií organismů zahrnujících řasy, bakterie, prvoky a houby. V navrhovaném projektu propojíme moderní molekulární metody s tradičním fluorescenčním značením (hostitele i kolonizátora) a analýzou obrazu, což poskytne jedinečnou příležitost zkoumat mikrobiální interakce na úrovni jedné konkrétní buňky, kolonie či celé populace přímo v jejich přirozeném prostředí. Zaměříme na vysvětlení změn druhového složení bakteriálních kolonizátorů a exprese jejich genů v závislosti na fyziologickém stavu rozsivkového hostitele a přítomnosti přisedlých prvoků a hub. Podrobně rozebereme ekologický význam těchto konsorcií ve sladkovodních potravních sítích. Vytvoříme koncepční model aktivity přisedlých eukaryotních mikroorganismů a toku uhlíku ve vodních ekosystémech.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Apr 1, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
11,061 thou. CZK
Public financial support
11,061 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK