Investigating the developmental function of the BnaTAA1 gene family in Brassica napus
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202300001
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-06140S
Alternative language
Project name in Czech
Studium role genové rodiny BnaTAA1 ve vývoji Brassica napus
Annotation in Czech
Auxin je fytohormon nezbytný pro morfogenezi rostlin. Enzymy TRYPTOPHAN AMINOTRANSFERASE OF ARABIDOPSIS (TAA1) a flavin monooxygenása YUCCA produkují auxin z tryptofanu. Snížená produkce auxinu u mutantů taa1 a yucca u Arabidopsis ovlivňuje vývoj rostlin, plodnost a reakce na stres. Cílem tohoto projektu je funkční analýza rodiny genů BnaTAA1 u alotetraploidního druhu B. napus. Identifikovali jsme dva páry homoeologů BnaTAA1 a 5 lokusů BnaTAR, genů příbuzných BnaTAA1. V rámci projektu budeme kombinovat bioinformatické metody s analýzou exprese genů, vývojem reportérů, indukcí CRISPR mutantů a jejich fenotypováním a analýzou aktivity BnaTAA1. Vyvinuli jsme systém indukce transformovaných kořenů „hairy roots“, který bude použit pro studium promotorů a editaci genomu. S použitím in vitro kultur budeme regenerovat stabilní transgenní rostliny. Stejnou metodikou budou vytvořeny auxinové reportéry pro sledování hladiny a distribuce tohoto hormonu v řepce. Výsledky výzkumu pomohou objasnit regulaci auxinu ve vývoji řepky a v reakci na stres.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10605 - Developmental biology
OECD FORD - secondary branch
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
OECD FORD - another secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
9,995 thou. CZK
Public financial support
9,995 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK