Harnessing the power of single-step selections
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202400001
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
24-11134S
Alternative language
Project name in Czech
Využití potenciálu jednokrokových selekcí
Annotation in Czech
Umělá evoluce je efektivní metoda, která umožňuje izolovat nukleové kyseliny s požadovanou funkcí z velkých kombinatorických knihoven. Naše skupina nedávno vyvinula postup, který umožňuje provádět tyto izolace v jediném kroku namísto deseti či více, které jsou obvykle vyžadovány, pomocí strukturovaných knihoven a sekvenování nové generace. V předkládaném projektu použijeme tuto techniku k řešení několika vybraných problémů, které nelze snadno prozkoumat pomocí konvenčních selekčních protokolů. Patří mezi ně například otázky, zda jsou lepším katalyzátorem DNA nebo RNA molekuly, do jaké míry mohou různé kovové ionty působit jako kofaktory v reakcích štěpení RNA nebo jaké jsou limity chemiluminiscenčních a fluorescenčních deoxyribozymů s ohledem na fenotypy, jako jsou katalytická účinnost či termostabilita. Neméně důležitý je také popis substrátové specificity enzymů upravujících DNA ve skupině proteinových enzymů APOBEC. Tyto příklady vyzdvihují značný potenciál a možnosti jednokrokových selekcí.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10609 - Biochemical research methods
OECD FORD - secondary branch
10610 - Biophysics
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
BO - Biophysics<br>CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Feb 27, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
8,705 thou. CZK
Public financial support
8,594 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
111 thou. CZK