All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Inferring the functional evolution of the termite gut microbiota using thousands of complete prokaryotic genomes

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    SGA0202400001

  • Main participants

    Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    24-12674S

Alternative language

  • Project name in Czech

    Stanovení evoluce funkcí střevních mikroorganismů termitů z tisíců kompletních prokaryotických genomů

  • Annotation in Czech

    Termiti hostí různorodá společenstva střevních mikrobů, kteří tráví organickou hmotu ve dřevě či v půdě. Zatímco taxonomické složení a obecné funkce střevních prokaryotických společenství jsou známé u řady termitů, specifické metabolické funkce byly jen vzácně přiřazeny jednotlivým bakteriálním kmenům. Absence kompletních prokaryotických genomů znemožňuje studovat evoluci střevních mikrobů. Navrhujeme použít PacBio HiFi sekvencováni a inovativní fylogenetickou shlukovou analýzu pro přípravu tisíců kompletních prokaryotických genomů ze střev 50 druhů termitů reprezentující taxonomickou i ekologickou diverzitu této skupiny. Zjištění všech metabolických drah prokaryotických kmenů endemických pro střevo termitů nám umožní zkoumat evoluci metabolických schopností hlavních linií mikrobů z termitích střev. Určíme také míru horizontálního přenosu genů a vliv potravy hostitele a endosymbiotického způsobu života na metabolický potenciál mikrobů. Naše výsledky přinesou unikátní vysvětlení evoluce střevní mikroflóry termitů.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • OECD FORD - main branch

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

  • OECD FORD - secondary branch

  • OECD FORD - another secondary branch

  • CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    EB - Genetics and molecular biology

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2024

  • Realization period - end

    Dec 31, 2026

  • Project status

    Z - Beginning multi-year project

  • Latest support payment

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP24-GA0-GA-R

  • Data delivery date

    Feb 22, 2024

Finance

  • Total approved costs

    10,593 thou. CZK

  • Public financial support

    10,593 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK