Machine-learning enhanced quantum chemistry for biomolecules in solution
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202500001
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
25-16109S
Alternative language
Project name in Czech
Strojové učení a kvantová chemie pro biomolekuly v roztoku
Annotation in Czech
Popis biomolekul pomocí metod výpočetní chemie vyžaduje také modelování jejich přirozeného vodného prostředí. V poslední době jsme prokázali výhody použití semiempirických kvantově-mechanických metod pro výpočet protein-ligand interakcí, které mají důležité aplikace v počítačovém návrhu léků. Vývoj těchto metod se soustředil především na popis molekulárních vlastností v plynné fázi a přesnost těchto metod v solvatovaných systémech je nyní omezena především samotným modelem rozpouštědla. Zde navrhujeme způsob, jak překonat současná omezení kombinací lepšího fyzikálního modelu rozpouštědla s korekcí založenou na strojovém učení. Pro její parametrizaci budou vygenerována nová, přesná referenční data. Výsledná metoda by měla přinést přelom v rychlých, ale přesných kvantově-mechanických výpočtech biomolekulárních systémů s tisíci atomy. Její použitelnost v demonstrujeme přímo na protokolech počítačového návrhu léků.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10403 - Physical chemistry
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GA-R
Data delivery date
Mar 6, 2025
Finance
Total approved costs
6,549 thou. CZK
Public financial support
6,126 thou. CZK
Other public sources
423 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK