QTL-driven expression profiling: dissection of gene-environment, pharmacogenetic interactions using a comprehensive systém of inbred and congenic rats
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 6 (SGA02004GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Profily exprese na základě QTL: analýza interakcí genů s prostředím a farmakologickým ovlivněním pomocí sestavy inbredních a kongenních kmenů potkana
Annotation in Czech
Komplexní determinace nemocí, nejčastějí se vyskytujících v moderních společnostech není dána jen značným počtem zodpovědných genů. Teprve spletitá síť vztahů mezi genetickou komponentou a faktory vnějšího prostředí (dynamická genetická architektura) zodpovídá za konečnou formu manifestace daného onemocnění. Odhalení jednotlivých komponent značně usnadňuje studium modelových organismů, především laboratorního potkana a myší, u nichž již byla dokončena sekvenace genomu. Provedli jsme rozsáhlou fenotypizaci a genotypizaci dvou segregujících populacíí laboratorního potkana a prokázali jsme vazbu několika oblastí genomu s poruchami metabolismu lipidů, sacharidů a adipozitou. Na základě těchto výsledků navrhujeme projekt systematické analýzy expresních profilů kandidátních genů za měnících se podmínek vnějšího prostředí (dieta, podávání farmak). Tuto studii navrhujeme provést v uceleném systému kongenních a násobně kongenních kmenů potkana. K následné dekonstrukci dynamické genetické
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Differential linkage analysis of metabolic syndrome: introgression of a defined segment of SHR chromosome 4 into the system of two segregating populations allowed us to map its role and influence on the shift of genetic architecture of metabolic syndrome
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-GA0-GA-U/03:2
Data delivery date
Oct 16, 2007
Finance
Total approved costs
3,786 thou. CZK
Public financial support
3,786 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK