Functional genomics of nuclear hormone receptors in Caenorhabditis elegans
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
301/05/0859
Alternative language
Project name in Czech
Funkční genomika jaderných receptorů Caenorhabditis elegans
Annotation in Czech
Jaderné hormonální receptory jsou transkripční faktory, které regulují metabolismus a vývoj všech metazoí. Některé receptory z rodiny jaderných receptorů jsou regulované ligandy, malými hydrofobními molekulami jako jsou retinoidy, farnesoidy a steroidy,zatímco pro sirotčí receptory (ophan) ligandy nejsou známé. U háďátka, Caenorhabditis elegans, tato skupina receptorů je neočekávaně velká a obsahuje více než 280 genů. Toto množství je daleko prevyšuje množství genů nalezených v genomech savců a Drosofily melanogaster. V naší dřívější práci jsme charakterizovali vývojové funkce receptoru CHR3 (NHR-23) , který je homologem DHR3 u Drosofily a ROR/RZR u savců. Při hledání jaderných receptorů, které regulují vývoj C. elegans jsme objevili funkci dalších dvou jaderných receptorů : NHR-40 a NHR-60. Oba receptory patří do podskupiny jaderných receptorů C. elegans , která má charakteristický P-box CNGCKT. NHR-60 patří do funkční kaskády regulované CHR3 (NHR-23) v seam buňkách a překvapivě je
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EA - Morphology and cytology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The aim of the project was to contribute to the understanding of the regulatory roles of nuclear hormone receptors (NHRs) in nematodes. We planed to study a subgroup of NHRs containing the P box sequence CNGCKT and to study the gene cluster R07B7.14 to C
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
4,856 thou. CZK
Public financial support
4,856 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK