All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Uncovering regulatory networks in novel mouse models by genetical genomics

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)

  • Main participants

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    301/07/1264

Alternative language

  • Project name in Czech

    Odkrytí regulačních sítí na nových myších modelech metodou genetické genomiky

  • Annotation in Czech

    Jako první krok v celogenomové analýze genetických regulačních procesů navrhujeme provést analýzu kontroly genové exprese v myším mozku pomocí genetické genomiky. S využitím souboru mezidruhových myších chomosomálních substitučních kmenů jako modelovýchorganismů a oligonukleotidových sestav (arrays) fy Affymetrix a Illumina pro expresní profilování vytvoříme 21 katalogů genů diferenciálně exprimovaných v mozku. Každý katalog bude obsahovat geny, jejichž diferenciální exprese je regulována z jednoho určitého chromosomu (katalog č. 1 bude obsahovat geny regulované z chromosomu č. 1 atd.). Další dva katalogy budou obsahovat: (1) geny přednostně exprimované v mozku jednoho pohlaví a (2) jaderné geny jejichž exprese je modifikována přítomností PWD mitochondrií u C57BL/6-mitPWD konplastického kmene. Po ověření heritability hladin transkriptů bude na segregujících populacích analyzován podsoubor diferenciálně exprimovaných genů pomocí qRT PCR k přesnému genetickému mapování regulačních faktorů.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • CEP - secondary branch

  • CEP - another secondary branch

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    .

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2007

  • Realization period - end

    Dec 31, 2009

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Apr 22, 2009

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP10-GA0-GA-U/02:2

  • Data delivery date

    Jan 22, 2015

Finance

  • Total approved costs

    8,860 thou. CZK

  • Public financial support

    8,860 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK