Uncovering regulatory networks in novel mouse models by genetical genomics
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
301/07/1264
Alternative language
Project name in Czech
Odkrytí regulačních sítí na nových myších modelech metodou genetické genomiky
Annotation in Czech
Jako první krok v celogenomové analýze genetických regulačních procesů navrhujeme provést analýzu kontroly genové exprese v myším mozku pomocí genetické genomiky. S využitím souboru mezidruhových myších chomosomálních substitučních kmenů jako modelovýchorganismů a oligonukleotidových sestav (arrays) fy Affymetrix a Illumina pro expresní profilování vytvoříme 21 katalogů genů diferenciálně exprimovaných v mozku. Každý katalog bude obsahovat geny, jejichž diferenciální exprese je regulována z jednoho určitého chromosomu (katalog č. 1 bude obsahovat geny regulované z chromosomu č. 1 atd.). Další dva katalogy budou obsahovat: (1) geny přednostně exprimované v mozku jednoho pohlaví a (2) jaderné geny jejichž exprese je modifikována přítomností PWD mitochondrií u C57BL/6-mitPWD konplastického kmene. Po ověření heritability hladin transkriptů bude na segregujících populacích analyzován podsoubor diferenciálně exprimovaných genů pomocí qRT PCR k přesnému genetickému mapování regulačních faktorů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 22, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Jan 22, 2015
Finance
Total approved costs
8,860 thou. CZK
Public financial support
8,860 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK