Artificial Evolution of Thermostable Elongation Factor Tu
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Umělá evoluce termostabilního elongačního faktoru Tu
Annotation in Czech
Pravidla, která by vysvětlila termostabilitu proteinů nebyla dosud definována. V naší laboratoři hledáme molekulární prvky odpovědné za termostabilitu elongačního faktoru Tu (EF-Tu) z Bacillus stearothermophilus v rámci celého rodu Bacillus. EF-Tu jsou trojdoménové, vysoce homologní GTP-bílkoviny nepostradatelné při biosyntéze proteinů. Změření tepelné stability osmi různých chimerních forem EF-Tu vytvořených z domén EF-Tu z mezofilní Escherichia coli a termofilního B. stearothermophilus ukázalo, že sena stabilitě zásadním způsobem podílí mezidoménová kooperativita, která souvisí se strukturou mezidoménových povrchů. Jako další a nezávislý postup navrhujeme využít metody "řízené evoluce" termostabilních bílkovin. Pomocí PCR budou náhodně mutovány celégeny tuf, kódující EF-Tu, z Bacillus subtilis a B. stearothermophilus a vedle toho jen oblasti EF-Tu, které se podílejí na mezidoménových interakcích. Mutované geny budou poté exprimovány v bakteriích a selektovány proteiny s nejvyšší termostabilitou. To
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
This is the first systematic attempt to underline functional and structural similarities and divergences between highly homologous three-domain proteins, elongation factors EF-Tu from G-, mesophilic Escherichia coli (Ec) and G+, thermophilic Bacillus ste
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Data delivery date
Jun 2, 2008
Finance
Total approved costs
5,624 thou. CZK
Public financial support
2,798 thou. CZK
Other public sources
2,826 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK