Determination of the histone H5 globular domain position within the native nucleosome using cryo-electron microscopy and single particle reconstruction.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
304/05/2168
Alternative language
Project name in Czech
Určení pozice globulární domény histonu H5 v nativním nucleosomu pomocí kryo-elektronové mikroskopie a rekonstrukce isolované částice.
Annotation in Czech
První stupeň organizace chromatinu, 30nm chromatinové vlákno, stále zůstává částečně nevyřešen, zejména jeho přechod z relaxované zig-zag struktury existující při nízké koncentraci iontů do kompaktního vlákna za fyziologických podmínek. Je zřejmé, že přítomnost spojovacího histonu je nezbytná pro organizovaný přechod do kompaktního stavu. Nicméně, přesná poloha tohoto histonu stále představuje nevyřešený problém. Jeho přesná poloha vzhledem k histonovému oktaméru a vstupující a vystupující DNA je určující pro topologické vlastnosti jak jednotlivého nukleosomu, tak celého chromatinového vlákna. Tento projekt zamýšlí určit pozici globulární domény histonu H5 v nativním nukleosomu pomocí kryo-elektronové mikroskopie a rekonstrukce objektu. Očekávanývýsledek by měl vyřešit přetrvávající nejednoznačnosti v určení pozice H5, které existují v literatuře již téměř deset let. Určení strukturálního uspořádaní vstupní-výstupní oblasti nukleosomu bude podstatné pro pochopení organizace chromatinového vlákna
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EA - Morphology and cytology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The original aim of the project i.e. the determination of the position of the linker histone H5 globular domain within the nucleosome has not been reached, particularly due to reasons stated in the paragraph 2. of the part ZC. Those reasons induced the m
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
2,661 thou. CZK
Public financial support
2,639 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
32 thou. CZK