Expression-profiling of chemokine ligands and receptors in pulmonary sarcoidosis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
310/05/2614
Alternative language
Project name in Czech
Expresní profilování chemokinových ligandů a receptorů u pulmonární sarkoidózy
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na molekulární děje, probíhající během migrace leukocytů z krevního oběhu do bronchoalveolárního prostoru u pacientů s plicní sarkoidózou - zánětlivým CD4+ granulomatózním onemocněním Thl typu. V buňkách získaných z bronchoalveolární laváže od pacientů se sarkoidózou bude metodou reál time RT-PCR kvantifikována mRNA exprese genů, uplatňujících se na migračních procesech řízenými chemokiny. Tato bude následně srovnána s expresí u kontrolních jedinců. Exprese upregulováných genů bude dále sledována na proteinové úrovni v lavážní tekutině proteomickými metodami. Kromě genů pro chemokinové ligandy a receptory budou analyzovány také jiné vybrané prozánětlivé geny např. pro cytokiny, transkripční faktory atd. Srovnání "nemocný" vs. "zdravý" bude doplněno korelací mRN A/proteinového expresního profilu s klinickým feno typem sarkoidózy (mírná vs. chronická, resp. progredující forma). Cílem projektuje identifikovat klíčové molekuly, které hrají roli při zahájení a dalším vývoji zánětu
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EC - Immunology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
FC - Pneumology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30102 - Immunology<br>30203 - Respiratory systems
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project first phase identified two stably expressed genes (PSMB2, RPL32) suitable for the normalisation of gene expression studies in BAL cells from patients across a spectrum of lung diseases. The constant expression of these genes was validated in
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
3,297 thou. CZK
Public financial support
3,297 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK