Case-control study on colorectal carcinoma: genetic profiling of xenobiotic metabolising and DNA repair enzymes
Project goals
Tumourigenesis represents a complex, multistage process that may be modulated by genetic polymorphisms in a number of biotransformation (XME) and DNA repair genes. Colorectal cancer (CRC) is a common disease in both men and women and its incidence in Europe is very high. In the majority of cases, low penetrance genes may be important in terms of individual susceptibility to an increased CRC risk, particularly in certain combinations. This project will be mainly aimed at the evaluation of links between individual genetic background (evaluation of polymorphisms in both DNA repair and XME genes) and expression levels in peripheral blood lymphocytes of studied polymorphic genes in CRC patients and healthy controls from population of the Czech Republic. Wewould like to analyse modulation effects of combinations of polymorphisms in XME and DNA repair genes with the aim to trace up the relatively positive and relative adverse combinations. These data on individual susceptibility are of
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
310/05/2626
Alternative language
Project name in Czech
Genetický profil genů metabolismu xenobiotik a DNA reparace u kolorektálního karcinomu v České republice : studie pacientů a kontrol
Annotation in Czech
Komplexní proces karcinogenese zahrnuje mnoho kroků, které mohou být ovlivněny genetickými polymorfismy v genech kódujících biotransformační (XME) a DNA reparační enzymy. Kolorektální rakovina (CRC) je velmi rozšířeným onemocněním jak u mužů, tak i u žen, a její incidence v Evropě je velmi vysoká. Geny s nízkou penetrancí mohou ve většině případů představovat velmi významný faktor individuální vnímavosti k vývoji CRC, a to především v jistých kombinacích. Předkládaný projekt bude zaměřen na zhodnocení vztahů mezi individuálním genetickým podkladem (hodnocení polymorfismů u genů DNA reparace a u genů účastnících se biotransformace) a hladinami expresí (stanovenými v periferních lymfocytech) u sledovaných polymorfních genů u pacientů s CRC a zdravých kontrol v české populaci. Naše pozornost bude zaměřena na ovlivňující účinky kombinací jednotlivých polymorfismů v XME a DNA reparačních genech s cílem vymezit relativně pozitivní a relativně negativní kombinace polymorfismů. Očekávané informace
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
FD - Oncology and haematology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30204 - Oncology
30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The main outcome of the present project was a thorough investigation of the role of numerous important genetic polymorphisms in genes of DNA repair pathways, insulin signalling pathway and metabolism of xenobiotics, on the risk of sporadic colorectal can
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
4,780 thou. CZK
Public financial support
4,780 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
4 780 CZK thou.
Public support
4 780 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
FD - Oncology and haematology
Solution period
01. 01. 2005 - 31. 12. 2007