Odor and Pellet Morphology as a Marker of Secondary Metabolites Production in a Microbial Culture

Provider

Czech Science Foundation

Programme

Standard projects

Call for proposals

—

Main participants

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Contest type

—

Contract ID

—

Project name in Czech

Pachy a morfologie pelet jako marker schopnosti kultury mikroorganismůprodukovat sekundární metabolity.

Annotation in Czech

Vláknité mikroorganismy jako aktinomycety či houby jsou významnými producenty biologicky aktivních látek. Jednotlivé fáze jejich kultivace (růstová, produkční a deklinační) jsou provázeny změnami v morfologii buněk vytvářejících nepravidelné pelety a tvorbou charakteristického pachu. Je známo, že z mikroskopického obrazu kultury, případně produkovaného pachu, umí zkušený průmyslový mykolog okmažitě odhadnout, o kterou fázi kultivace se jedná. V tomto projektu chceme tyto markery produkce sekundárních meabolitů objektivizovat s užitím prvků umělé inteligence pro analýzu změn morfologie tvaru pelet pomocí fraktálů a vyhodnocením chromatografického spektra složení pachů pomocí Hammingovy neuronové sítě, či znalostních fuzzy modelů. Jako modelový organismubyl vybrán Streptomyces avermitilis, který je významný producent látek s antihelmitickou aktivitou.

R&D category

—

CEP classification - main branch

EI - Biotechnology and bionics

CEP - secondary branch

EE - Microbiology, virology

CEP - another secondary branch

—

OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Realization period - beginning

Jan 1, 1994

Realization period - end

Jan 1, 1996

Project status

U - Finished project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP/1997/GA0/GA07GA/V/9:7

Data delivery date

—

Total approved costs

300 thou. CZK

Public financial support

450 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK