Development of a combined RAPD/PCR/DGGE method for the detection of DNA polymorphism in cultivars of ornamental plants
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Ústav molekulární biologie rostlin AV ČR
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj kombinované RAPD/PCR/DGGE metody pro stanovení DNA polymorfismu kultivarů okrasných rostlin
Annotation in Czech
Bude vyvinuta kombinovaná RAPD/PCR/DGGE metoda pro detekci DNA polymorfismu u okrasných rostlin rodů Impatiens, Tulipa, Rhododendron, Chrysanthemum, která by byla prakticky použitelná pro sledování průběhu šlechtění a právní ochranu jeho výsledků. Strategie bude spoléhat na klasickou PCR metodu s dlouhými primery, amplifikující silně variabilní oblasti genomu. Sekvence primerů odvodíme jednak ze známých sekvencí rRNA genů jiných rostlin, jednak sekvenováním vybraných RAPD markerů. Rozlišovací schopnostpolymorfních oblastí mezi rRNA geny a RAPD nalezených nespecifických variabilních oblastí zvýšíme gradientovou denaturační elektroforézou, která citlivě odhalí sekvenční diference uvnitř fragmentů. Nejlepší markery budou sekvenčně charakterizovány a stanovena jejich taxonomická hodnota.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
GE - Plant cultivation
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1995
Realization period - end
Jan 1, 1997
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1997/GA0/GA07GA/V/9:7
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
1,054 thou. CZK
Public financial support
1,054 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK