Molecular methods in situ hybridization,LCR and PCR for detection of beet necrotic yellow vein virus and plum pox virus

Provider

Czech Science Foundation

Programme

Standard projects

Call for proposals

—

Main participants

Česká zemědělská univerzita v Praze

Contest type

—

Contract ID

—

Project name in Czech

Molekulární metody hybridace in situ, LCR a PCR ke stanovení viru nekrotické žluté žilkovitosti řepy a viru šarky švestky

Annotation in Czech

Cílem navrhovaného projektu je vypracovat metodu detekce RNA viru nekrotické žluté žilkovitosti řepy (BNYVV) v rostlinných plevelech a molekulární metodu detekce viru šarky švestky (PPV) v relativně odolných ovocných dřevinách. RNA1, RNA2, RNA3 a RNA4 BNYVV budou stanoveny metodou hybridizace in situ na řezech z infikovaných pletiv řepy a dalších hostitelských rostlin. Metoda bude využita ke studiu infekčního procesu a mechanismu přenosu BNYVV houbou Polymyxa betae. Bude vypracována metoda ligázové řetězové reakce, vhodná pro detekci nejkonzervativnějších sekvencí PPV NIb proteinu. Citlivost ligázové řetězové reakce PPV bude porovnána s PCR a ELISA v detekci PPV v ovocných stromech. Metoda bude uplatněna při stanovení nízkých koncentrací PPV v rostlinách.

R&D category

—

CEP classification - main branch

EB - Genetics and molecular biology

CEP - secondary branch

GE - Plant cultivation

CEP - another secondary branch

—

OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Realization period - beginning

Jan 1, 1995

Realization period - end

Jan 1, 1997

Project status

K - Ending multi-year project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP/1997/GA0/GA07GA/V/9:7

Data delivery date

—

Total approved costs

2,374 thou. CZK

Public financial support

2,374 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK