Functional genomics of hop (H. lupulus L.) with respect to genes co-determining lupulin production
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Funkční genomika chmelu (H. lupulus L.) s ohledem na geny kodeterminující produkci lupulinu
Annotation in Czech
Projekt zahrnuje strukturní a funkční analýzu genomové organizace homologů chalkonsytázových (chs) genů, které byly v současné době identifikovány jako determinanty biosyntézy hořkých kyselin produkovaných ve žláznatých trichomech hlávek chmelu, cennýchpro výrobu piva a dále prenylovaných flavonoidů, jež jsou studovány pro své potenciální protirakovinové účinky. Jak vyplývá z naší předešlé práce, chmelové homology chs genů tvoří genové rodiny a jejich tkáňově specifická exprese je přísně regulována. Jeproto důležité identifikovat regulační faktory odpovědné za významné rozdíly mezi jednotlivými kultivary chmelu v obsahu těchto sekundárních metabolitů. S cílem přispět k řešení této problematiky projekt zahrnuje konstrukce genomové a cDNA knihovenchmelu,u kterých bude proveden jednak "screening" homologů chs genů, jejich klastrů i promotorových regulačních sekvencí a jednak sekvencí příbuzných R2R3 MYB genům, z nichž některé jsou známy jako regulační faktory homologických biosyntetických drah
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
GE - Plant cultivation
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
In the recent project genomic (l-GEM-11) and cDNA (Uni-ZAP-XR) libraries specific for Czech hop were constructed and screened. New sequences and hop genes exhibiting expression in hop cones were characterized. In particular, the oligofamily of hop genes
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-GA0-GA-U/07:6
Data delivery date
Jan 15, 2009
Finance
Total approved costs
5,517 thou. CZK
Public financial support
2,944 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
2,573 thou. CZK