Targeted isolation of molecular markers and comparative genome mapping in chickpea, field bean and garden pea
Project goals
Chickpea, field bean and pea represent economically important legumes. They provide an important source of human dietary protein and are used as livestock feed. By fixing atmospheric nitrogen, they reduce the use of chemical fertilizer and improve soiland water quality. In future, increased cultivation of legumes will be required to ameliorate environmental degradation, reduce the depletion of non-renewable resources, and provide adequate nitrogen for the population. Unfortunately, various diseasesand pests hamper the efforts to increase the production of legumes. In addition, there is a demand for new cultivars with increased and stable yield and improved quality. Such targets are hard to achieve using traditional approaches. This project aims toadvance genetic and physical mapping in the three legumes by (i) increasing the density of genetic maps at regions containing genes linked to traits of interest, (ii) integrating genetic and physical maps and (iii) exploring the extent of linkage
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Cílená izolace molekulárních markerů a srovnávací mapování genomů cizrny, bobu a hrachu
Annotation in Czech
Cizrna, bob a hrách jsou ekonomicky významné leguminózy, které slouží jednak jako zdroj proteinů pro lidskou výživu, jednak jako krmivo pro domácí zvířata. V souvislosti se snahou o zlepšování životního prostředí, snižování čerpání neobnovitelnýchpřírodních zdrojů a zajišťování dostatku proteinů pro výživu lidstva lze očekávat, že leguminózy budou v budoucnu nabývat stále většího významu. Snahy o zvýšení jejich produkce však naráží na potíže s citlivostí stávajících odrůd vůči chorobám a škůdcům.U nověšlechtěných odrůd jsou vedle požadavků na rezistenci kladeny nároky také na zvýšenou kvalitu a stabilitu výnosu. Těchto cílů lze jen obtížně dosáhnout pomocí tradičních postupů. Záměrem tohoto projektu je urychlit genetické a fyzické mapování utří vybraných leguminóz, a to zejména: (i) zvýšit hustotou genetických map v oblastech osahujících geny vázané na ekonomicky významné znaky, (ii) integrovat genetické a fyzické mapy, a (iii) ověřit rozsah kolinearity genomů cizrny, bobu a hrachu. Těchto
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
GE - Plant cultivation
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EF - Botany
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10611 - Plant sciences, botany
10612 - Mycology
30101 - Human genetics
40105 - Horticulture, viticulture
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The results obtained greatly expanded the knowledge of molecular organization of nuclear genomes in several species of legumes and resulted in development of unique molecular resources for genome analysis and gene cloning. Novel results were obtained on
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-GA0-GA-U/07:6
Data delivery date
Jan 15, 2009
Finance
Total approved costs
7,878 thou. CZK
Public financial support
4,238 thou. CZK
Other public sources
3,640 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
7 878 CZK thou.
Public support
4 238 CZK thou.
53%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
GE - Plant cultivation
Solution period
01. 01. 2003 - 01. 01. 2005