The use of molecular techniques for understanding of genetic and pathogenic variability in population Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Main participants
Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Analýza genetické a patogenní variability v populaci Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus molekulárními technikami
Annotation in Czech
Bakteriální kroužkovitost bramboru, způsobená Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus (Cms) je potenciální hrozbou pro bramborářství. Způsobuje jednak vadnutí a odumírání rostlin, jednak hnilobu skladovaných hlíz. V celém světě je Cms považován za významného karanténního patogena. Specifické karanténní požadavky pro Cms vyžadují laboratorní testování metodami, které jsou detailně uvedeny ve Směrnici Rady EU (1993).Primárním záměrem projektu je analyzovat variabilitu virulence izolátů Cms. Pro studium změn antigenních a patogenních vlastností patogena budou jako modelové objekty použity fluidní a nefluidní formy kolonií Cms. Cílem je pokusit se o stanovení genetické podstaty změn v morfologii kolonií MS metodou randem priming PCR. Odlišné amplifikační produkty charakteristické pro daný fenotyp budou klonovány, bude ověřována jejich unikátnost a sekvenovány. Hlavním záměrem je zlepšit metodu stanovení latentní infekce Cms v rostlinném materiálu, a to zejména nahrazením časově náročných
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
CEP - secondary branch
GE - Plant cultivation
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Projekt byl zaměřen na stanovení genetické, imunochemické, biochemické a patogenní variability u fluidních a nefluidních forem původce bakteriální kroužkovitosti bramboru Clavibacter michiganensis subsp.sepedonicus (Cms). V průběhu řešení projektu bylo
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2002
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7
Data delivery date
May 19, 2008
Finance
Total approved costs
4,050 thou. CZK
Public financial support
3,103 thou. CZK
Other public sources
1,207 thou. CZK
Non public and foreign sources
140 thou. CZK