Cytogenetic study of nuclear chromatin organization in plants
Project goals
Main body of cytogenetic data in flowering plants comes from the observations on mitotic chromosomes. Linear structure of chromosomes (ordered arrangement of genes, heterochromatin domains, location of prominent chromosomal structures as telomeres andcentomeres) has substantial significance on gene expression and DNA replication during interphase. The knowledge of genome organisation and function is a critical point in understanding the physiologiclal processes during plant growth and development. Inourprevious work with we elaborated immunocytochemical detection of transcribed chromatin in both, mitotic chromosomes and interphase nuclei and brought some indirect evidence of the correlation of chromatin activity with early replication andlocalisationof the majority of genes. Since plants with small and large genomes have different organisation of chromatin, we propose to conduct a comparative study to follow gene loci and prominent chromosomal landmarks in both, chromosomes and
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Studium organizace rostlinného jaderného chromatinu
Annotation in Czech
Genetická informace eukaryot je uložena v lineárních strukturách, DNA a chromozómech. Lokalizace genů na chromozomu má velký význam na genovou expresi i replikaci DNA a ostatní spojené fyziologické projevy rostlinné buňky. Tyto projevy se však uplatňujízejména v interfázi. Znalost struktury a funkci interfázního jádra je zásadním předpokladem pro porozumění růstovým a vývinovým procesům u rostlin. Během naší předchozí práce jsme vyvinuli imunocytochemické metody, kterými jsme detekovali aktivituchromatinu jednak na mitotických chromozómech, jednak v interfázních buněčných jádrech. Přinesli jsme řadu důkazů o korelaci aktivity chromatinu s časnou replikací chromozómových oblastí bohatých na geny. Vzhledem k tomu, že rostliny s různě velkýmigenomy mají irůznou základní strukturu uspořádání jaderného chromatinu, chceme se v předloženém projektu soustředit na komparaci dvou modelů, Arabidopsis a Silene. Budeme studovat genové lokusy a výrazné chromozómové struktury (centroméry, teloméry, eu-
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
ED - Physiology
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10611 - Plant sciences, botany
10612 - Mycology
30101 - Human genetics
30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project was aimed to study the arrangement of plant nuclei in model species possessing different complexity of genomes, different structure of nuclear chromatin as well as polyploid species and hybrids. Common aspects of the research included various
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-GA0-GA-U/07:6
Data delivery date
Jan 15, 2009
Finance
Total approved costs
6,924 thou. CZK
Public financial support
3,226 thou. CZK
Other public sources
3,698 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
6 924 CZK thou.
Public support
3 226 CZK thou.
46%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
ED - Physiology
Solution period
01. 01. 2003 - 01. 01. 2005