Deep phylogeny of anaerobic fungi
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
523/05/2555
Alternative language
Project name in Czech
Hloubková fylogeneze anaerobních hub
Annotation in Czech
Anaerobní houby osidlují bachor přežvýkavců a tlusté střevo některých býložravců. Na základě morfologických charakteristik byly taxonomicky zařazeny do třídy Chytridiomycet, řádu Spizellomycetales a čeledi Neocallimasticacea. Bachorové houby však vykazují řadu vlastností jako je anaerobióza, mnohočetnost bičíků, nepřítomnost mitochondrií a výskyt hydrogenosomů či extrémně nízké zastoupení G+C párů v genomu, jež jsou v příkrém rozporu s morfologickými rysy typickými pro Chytridiomycety. V rámci čeledi Neocallimasticacea bylo opět na základě morfologie popsáno 5 rodů, dva polycentrické Orpinomyces a Anaeromyces a tři monocentrické Piromyces, Caecomyces a Neocallimastix. Avšak metody molekulární biologie založené na sekvenční analýze úseků rDNA poukázalyna to, že dělení anaerobních hub na monocentrické a polycentrické není z hlediska genetického opodstatněné a dále prokázaly značnou heterogenitu některých rodů. Klasifikace anaerobních hub a vztahy mezi rody i v rámci řádu a třídy zůstávají
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
GH - Nutrition of farm animals
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40201 - Animal and dairy science; (Animal biotechnology to be 4.4)<br>40202 - Pets
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Project Deep phylogeny of anaerobic fungi resulted in extensive phylogenetic study of Neocallimasticaceae fungi inhabiting gastrointestinal tract of ruminants based on sequence analysis of ribosomal DNA and genes coding evolutionary important proteins -
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Data delivery date
Dec 16, 2008
Finance
Total approved costs
3,025 thou. CZK
Public financial support
1,716 thou. CZK
Other public sources
1,963 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK