MHC class IIB genes of European cyprinid fish: their genetic variability and evolution in relation to the host life-history traits and parasitism
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 6 (SGA02004GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
MHC třída IIB genů evropských kaprovitých ryb: jejich genetická variabilita a evoluce ve vztahu k životní strategii hostitelů a parazitismu
Annotation in Czech
Studium MHC (major histocompatibility komplexu) genů je součástí projektů zaměřených nejen na studium imunitní odpovědi organismů na přítomnost antigenu. MHC představuje skupinu genů charakteristických přítomností vysoce polymorfních lokusů kódujících proteiny, které jsou schopny rozpoznat peptidický řetězec patogenu a stimulují imunitní odpověď. V součastné době jsou častým předmětem studia faktory vedoucí k rozsáhlému polymorfizmu MHC genů a jeho udržení. Patogenně řízena selekce a nebo selekce založená na preferencích spojených s párováním jedinců a vedoucích k zvýšení rezistence u potomstva, představují dvě ne protichůdné hypotézy, které mohou vysvětlit vysokou variabilitu MHC genů. Každopádně, důkazy podporující selekci zprostředkovanou patogeny jsou limitovány a nepřímé. Cílem předloženého projektu je studium variability alel skupiny IIB MHC u široké škály kaprovitých ryb náležejících do čtyřech podčeledí a fylogenetická analýza exonu 2 a 3. Využití různých molekulárních metod povede k
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EC - Immunology
CEP - another secondary branch
EG - Zoology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics<br>30102 - Immunology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The variability and polymorphism of DAB genes of MHC IIB were analyzed in cyprinid fish including the representatives of different subfamilies. The exon 2 sequences were identified as the targets of positive selection (potentially corresponding to the pa
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-GA0-GA-U/03:2
Data delivery date
Oct 16, 2007
Finance
Total approved costs
3,451 thou. CZK
Public financial support
2,951 thou. CZK
Other public sources
750 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK