Biodegradation of aromatic compounds by genetically optimized rhodococci in biofilm
Project goals
Increasing knowledge of biochemical and genetic bases of the metabolism of various environmental pollutants facilitates the development of bacterial strains for bioremediation using methods of recombinant DNA technology. Although the methods and tools developed in this project might be used for biodegradation of a wider range of xenobiotics by various bacterial strains, improvement of phenol degradation potential of a Rhodococcus strain, whose degradative capability has already been shown, will be theparticular aim. To achieve this objective, three main aspects of the biodegradation studies will be addressed: l. The properties of the strain will be improved by metabolic engineering based on the genetic analysis of the biodegradative patway and use ofthe tools of gene manipulations. 2. The advantages of the biofilm formation by the microorganism, namely resistance to higher concentrations of the toxic pollutants and higher rate of biodegradation, will be utilised. 3. Humic acids will be exploited as
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 6 (SGA02004GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Biodegradace aromatických látek geneticky optimalizovanými rhodokoky v biofilmu
Annotation in Czech
Přibývající poznatky o biochemických a genetických základech metabolismu různých látek znečišťujících životní prostředí umožňují zahájit vývoj bakteriálních kmenů pro bioremediace s použitím metod rekombinantní DNA. Třebaže metody a nástroje vyvinuté v rámci tohoto projektu by mohly být použity pro biodegradace širšího spektra xenobiotik různými bakteriálními kmeny, konkrétním cílem bude zlepšení schopnosti degradovat fenol u kmene rodu Rhodococcus, jehož degradační schopnost byla již prokázána. K dosažení tohoto cíle budou využity tři hlavní aspekty biodegradace: l. Vlastnosti kmene budou zlepšovány metabolickým inženýrstvím, založeným na genetické analýze biodegradační dráhy a na použití nástrojů pro genové manipulace. 2. Budou využity výhody tvorbybiofilmu mikroorganismem. Jsou to zvláště resistence k vyšším koncentracím toxických polutantů a vyšší rychlost biodegradace. 3. Jako surfaktanty usnadňující vstup degradované látky do buněk mikroorganismu, budou využity huminové kyseliny.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
DJ - Pollution and water control
CEP - secondary branch
DK - Contamination and decontamination of soil including pesticides
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
10511 - Environmental sciences (social aspects to be 5.7)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The capability of Rhodococcus erythropolis CCM 2595 to degrade phenol and other monoaromatic compounds was studied using methods of biochemistry, physiology, molecular genetics and biotechnology. New plasmid vectors for analysis of transcriptional signal
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-GA0-GA-U/03:2
Data delivery date
Oct 16, 2007
Finance
Total approved costs
2,131 thou. CZK
Public financial support
2,131 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Recognised costs
2 131 CZK thou.
Public support
2 131 CZK thou.
0%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
DJ - Pollution and water control
Solution period
01. 01. 2004 - 01. 01. 2006