Linking biogeochemisty of methane and molecular detection of methanogens and methanotrophs in river sediments.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
526-09-1639
Alternative language
Project name in Czech
Biogeochemie metanu a detekce metanogenních a metanotrofních bakterií v říčních sedimentech
Annotation in Czech
Naše dosavadní výzkumy na toku Sitka prokázaly, že produkce metanu v sedimentech a jeho plynné emise do ovzduší jsou poměrně významné a nezanedbatelné z hlediska lokálních zdrojů skleníkových plynů. Protože o produkci metanu v tekoucích vodách existuje doposud minimum informací, o jeho spotřebě metanotrofními baktériemi pak prakticky nevíme vůbec nic, je hlavním cílem našeho projektu studium prostorové distribuce metanogenních a metanotrofních bakterií v hyporheických sedimentech a objasnění rozdílů vezdrojích substrátů pro metanogenezi a produkci/spotřebě metanu během roku na různých lokalitách podél malého nížinného toku Sitka. Vzorky dnového sedimentu za účelem determinace bakteriálního společenstva a stanovení metanogenního potenciálu budou odebírány pomocí freeze-core metody. Detekce bakterií bude prováděna pomocí metody FISH (fluorescenční hybridizace in situ), cílené na specifické 16S rRNA sekvence a PCR, DGGE a T-RFLP, zaměřené na detekci genů kódujících specifické enzymy. Analýza stabilníchizotopů 13C/12C v plynných vzorcích metanu by měla poskytnout informaci o mechanismech vzniku a koloběhu CH4.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
DA - Hydrology and limnology
CEP - secondary branch
EH - Ecology - communities
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10501 - Hydrology<br>10502 - Oceanography<br>10503 - Water resources<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10617 - Marine biology, freshwater biology, limnology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The results of the project indicate that large communities of methanogenic Archae occur even in small streams and affect the diffusion/fluxes of methane from sediments to water. Main results are well described in the final project report. To date, main outputs are one paper in a SCI journal and one book chapter, other manuscripts are under review. Financial management is without any objections.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2012
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2012
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP13-GA0-GA-U/02:3
Data delivery date
May 17, 2016
Finance
Total approved costs
2,913 thou. CZK
Public financial support
2,913 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK