Study of structure-function relationship in cellobiose dehydrogenase - a promising enzyme for applications in biosensors and biofuel cells
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P206-12-0503
Alternative language
Project name in Czech
Studium vztahu mezi strukturou a funkcí cellobiosadehydrogenasy - atraktivního enzymu s uplatněním v biosenzorech a biopalivových článcích
Annotation in Czech
Cílem navrhovaného projektu je určení nativní konformace celobiosadehydrogenasy (CDH), atraktivního enzymu s celou řadou možných biotechnologických a elektrochemických aplikací. Kromě sestavení strukturního modelu je projekt zaměřen na stanovení vlivu pH a substrátu na strukturu proteinu a dále na studium interakce CDH s elektronovým akceptorem cytochromem c. Ke splnění vytčených cílů bude využita kombinace metod izotopové výměny, chemického zesítění, hmotnostní spektrometrie a molekulového modelování. Získaná strukturní data poskytnou hodnotné informace o vztahu mezi strukturou a funkcí CDH a rovněž budou využita metodami enzymového inženýrství k produkci unikátních forem enzymu pro praktické uplatnění v biosenzorech, biopalivových článcích a při bioelektrokatalýze. Projekt dále přispěje k objasnění procesu přenosu elektronu mezi CDH a cytochromem c a významně obohatí obecné znalosti o mechanismu přenosu elektronů u redoxních enzymů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EI - Biotechnology and bionics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10406 - Analytical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Significant results were achieved in the field of protein structure analysis. Knowledge on the structure and function of cellobiose dehydrogenase in solution was obtained. New proteolysis procedures were developed and a computer program for data interpreting was created. The project fulfilled its stated goals and the publication output is very good.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Apr 25, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
4,882 thou. CZK
Public financial support
4,882 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK