The role of p53 DNA structure-selective binding in brain cancer
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P301-10-2370
Alternative language
Project name in Czech
Úloha strukturně selektivní vazby proteinu p53 k DNA u nádorů mozku
Annotation in Czech
Nádory mozku patří mezi vysoce invazivní. Inaktivace specifických genů spolu s bodovou mutací nádorového supresorového genu TP53 je spojena s nepříznivou prognózou a možností na přežití. Mutantní proteiny p53 disponují specifickými aktivitami spojenými sagresivním charakterem nádorů, např. schopností regulovat řadu genů podporujících buněčný růst a tvorbu metastáz. V tomto projektu plánujeme spojit molekulární a nádorovou biologii s bioinformatikou ve snaze pochopit, předpovídat a mapovat úlohu vazby mutantního proteinu p53 na nekanonické struktury DNA (DNA triplexy) v regulačních oblastech cílových genů mutantních proteinů p53 (např. PPARGC1A, JAK2 a FRMD5). V návaznosti na náš předchozí výzkum budeme identifikovat nové nádorové markery pro gliomy nazákladě specifických interakcí mutantního proteinu p53 s DNA v těchto buňkách s využitím chromatinové imunoprecipitace a analýzy genové exprese. Dále se zaměříme na molekulární mechanismus invazivního charakteru glioblastom závislého na expresi mutantního p53 a na jeho možné využití při terapii především při výběru účinné látky.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
In the project, mutant p53 proteins associated with oncogenic character of glioblastoma cell lines and its binding to DNA were investigated. Analyses of gene expression in these cells and its classification might contribute to targeted therapy for glioblastomas. The results were published in four papers in impacted journals (a total value of IF equals to 17.4). Solving of the project is excellent.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 31, 2012
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2012
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP13-GA0-GA-U/02:3
Data delivery date
May 17, 2016
Finance
Total approved costs
1,757 thou. CZK
Public financial support
1,757 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK