DNA binding, stress-induced expression and transactivation activity of p73 protein isoforms
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.<br>Masarykův onkologický ústav
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P301-11-2076
Alternative language
Project name in Czech
Vazba na DNA, stresem indukovaná exprese a transaktivační aktivita izoforem proteinu p73
Annotation in Czech
Protein p73 patří mezi transkripční faktory rodiny p53, vykazuje vysokou homologii s proteinem p53 a je schopen aktivovat celou řadu genů, které se podílejí na regulaci buněčného cyklu a apoptózy. Podobně jako u proteinu p53 bylo identifikováno několik izoforem proteinu p73, které se liší strukturou, ale dosud chybí komplexnější data o jejich DNA-vazebných vlastnostech, vzájemné interakci a kooperaci, které mohou mít vliv na genovou expresi. Tento projekt je zaměřen (i) na in vitro studie rozpoznání různých DNA substrátů (nadšroubovicová, lineární, chemicky poškozená DNA) vybranými izoformami proteinů p73 a p53, a (ii) na DNA interakce a transaktivační aktivity exogenních a endogenních izoforem p73 a p53 ve vybraných buněčných liniích (s definovaným statutem p53) vystavených různým stresovým podmínkám. V těchto experimentech budou využity primárně metody imunoprecipitace p73 nebo p53-DNA komplexů, EMSA, prodlužování primerů pomocí DNA-polymeráz a PCR metody, p73/p53 promotor-specifické reportérové fůze a western blot analýzy exprese p73/p53 izoforem.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
FD - Oncology and haematology
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The postponement of the Report resulted in the improvement of the data presentation and publication of 7 articles in impacted, peer-reviewed journals. Investigators justified properly alterations in the project design, which ultimately provided the basis for further research. The Final Report might have been more readable and structered according to the aims and published articles.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Apr 13, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Sep 25, 2017
Finance
Total approved costs
5,953 thou. CZK
Public financial support
5,953 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK