Deciphering molecular details of the stringent decoding of the AUG start codon during eukaryotic translation initiation.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P305-10-0335
Alternative language
Project name in Czech
Studium molekulárních detailů klíčového procesu rozpoznání počátečního AUG kodónu během inciace translace u eukaryot.
Annotation in Czech
Přesné rozpoznání iniciačního kodónu je klíčovým krokem translace, neboť určuje správné nastavení čtecího rámce. Pro tento účel musí 40S ribozóm nejprve postupně pročítat/skenovat 5' nepřekládanou oblast mRNA a reagovat na celou řadu ne zcela známých signálů vycházejících ze vzájemných interakcí mezi ribozómem, mRNA a iniciačními faktory, které celý proces řídí. Tato aplikace si klade za cíl objasnit, za pomoci kvasinkového modelu v kombinaci s lidskými buněčnými liniemi, jak je tento proces ovlivňován více-podjednotkovým faktorem eIF3. Naše předchozí práce ukázala, že specifické mutace ve třech vzájemně se vážících podjednotkách eIF3 (a, b, j) buď oslabují nebo naopak posilují míru přesnosti celého jinak perfektně vyladěného procesu. Rádi bychom tedy s pomocí genetických, biochemických a strukturálně-biologických přístupů prokázali, že tyto tři podjednotky představují samostatně činný eIF3 modul, který ve spolupráci s eIF1 a eIF1A reguluje konformační změny 40S ribozómu, jichž je zapotřebí jak pro hladký průběh skenování, tak pro jeho okamžité zastavení po rozpoznání iniciačního AUG.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EA - Morphology and cytology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project produced priority results regarding the gene expression regulation. The summary card recapitulates adequately the achieved results. Within the project, 1 PhD thesis and 2 Master theses were defended. The results of the project were published in 4 papers in prestigious journals . No shortcomings regarding adherence to grant administration or funding rules were found.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 8, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:2
Data delivery date
Sep 30, 2017
Finance
Total approved costs
7,008 thou. CZK
Public financial support
7,008 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK