Molecular basis of the gene-specific translational control mechanism of yeast GCN4 and its mammalian functional homologue ATF4.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P305-11-0172
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární podstata genově specifického mechanismu translační kontroly kvasinkového genu GCN4, a genu jeho savčího funkčního homologa ATF4.
Annotation in Czech
Výzkum regulačních mechanismů translace nám poskytuje důležitý vhled do strategií, jimiž jsou v buňce řízeny procesy proliferace, diferenciace, apoptózy apod. My se zabýváme studiem regulačního mechanismu zvaného reiniciace, který pracuje na úrovni jednotlivých genů. Spočívá ve schopnosti 40S ribozómu obnovit proces skenování po právě dokončené translaci krátkého čtecího rámce (uORF) za účelem reiniciace na downstream start tripletu. Kvasinkový transkripční faktor GCN4 a jeho lidský funkční homolog ATF4, jejichž exprese je spuštěna jako odpověď na hladovění na aminokyseliny, bezpochyby představují dva nejlépe prostudované příklady reiniciace. 5’ netranslatovaná oblast jejich mRNA v sobě nese 4 popřípadě 2 uORF, které dohromady řídí velmi komplexní regulační systém jenž je závislý na dostupnosti eIF2•GTP•tRNAiMet ternárního komplexu v buňce. Naším cílem je 1) popsat molekulární mechanismus, kterým zejména uORF1 obou genů zajišťuje znovu započetí skenování post-terminujících ribozómů, a 2) zjistit, zda se 3’ netranslatovaná oblast GCN4 rovněž podílí na celkové regulaci exprese GCN4.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project is highly complex , utilizing a wide range of experimental and theoretical methods. Despite the fact, that some of the specific aims were not fulfilled or they were modified, one can assume that project as a whole was completed and brought valuable results.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Apr 7, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
7,668 thou. CZK
Public financial support
7,668 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK