Evolution of parasitism:analysis of genomes and key physiological functions of free-living Mastigamoeba balamuthi and pathogenic Entamoeba histolytica
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta<br>Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P305-11-1061
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce parazitismu: analýza genomů a klíčových fyziologických funkcí volně žijící améby Mastigamoeba balamuthi a patogena Entamoeba histolytica
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na studium evoluce parazitismu s využitím modelu volně žijící améby Mastigamoeba balamuthi a příbuzného lidského patogena Entamoeba histolytica. Srovnávací genomika volně žijících a příbuzných parazitických druhů je esenciální pro pochopení evoluce parazitismu a v důsledku i buněčných funkcí parazitických organismů. Očekáváme, že navrhovaná studie umožní identifikovat komponenty genomu, které vymizely během adaptace volně žijících organismů k parazitickému způsobu života, modifikace ancestrálních genů, které nabyly u parazitů nové funkce i získání zcela nových genů v souvislosti s parazitismem a patogenitou. Studie zahrnuje (i) sekvenaci genomu M. balamuthi, jeho bioinformatickou analýzu a porovnání s genomem E. histolytica, který je dostupný a (ii) srovnávací studium vybraných buněčných funkcí, k jejichž změnám došlo v souvislosti s tranformací volně žijících na parazitické organismy, zejména redukce mitochondrie, modifikace vesikulárního transportu a způsobu pohybu (ztráta bičíku, rozvoj amébovitého pohybu).
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project focused on a comparative analysis of genomes of free living and human parasites with the goal of obtaining new information on evolution of parasitism. The results were published in six impacted papers. Grant rules were satisfied.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Apr 25, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
9,106 thou. CZK
Public financial support
9,106 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK