All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Evolution of parasitism:analysis of genomes and key physiological functions of free-living Mastigamoeba balamuthi and pathogenic Entamoeba histolytica

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

  • Main participants

    Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta<br>Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    P305-11-1061

Alternative language

  • Project name in Czech

    Evoluce parazitismu: analýza genomů a klíčových fyziologických funkcí volně žijící améby Mastigamoeba balamuthi a patogena Entamoeba histolytica

  • Annotation in Czech

    Projekt je zaměřen na studium evoluce parazitismu s využitím modelu volně žijící améby Mastigamoeba balamuthi a příbuzného lidského patogena Entamoeba histolytica. Srovnávací genomika volně žijících a příbuzných parazitických druhů je esenciální pro pochopení evoluce parazitismu a v důsledku i buněčných funkcí parazitických organismů. Očekáváme, že navrhovaná studie umožní identifikovat komponenty genomu, které vymizely během adaptace volně žijících organismů k parazitickému způsobu života, modifikace ancestrálních genů, které nabyly u parazitů nové funkce i získání zcela nových genů v souvislosti s parazitismem a patogenitou. Studie zahrnuje (i) sekvenaci genomu M. balamuthi, jeho bioinformatickou analýzu a porovnání s genomem E. histolytica, který je dostupný a (ii) srovnávací studium vybraných buněčných funkcí, k jejichž změnám došlo v souvislosti s tranformací volně žijících na parazitické organismy, zejména redukce mitochondrie, modifikace vesikulárního transportu a způsobu pohybu (ztráta bičíku, rozvoj amébovitého pohybu).

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • CEP - secondary branch

    EE - Microbiology, virology

  • CEP - another secondary branch

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

  • Project results evaluation

    The project focused on a comparative analysis of genomes of free living and human parasites with the goal of obtaining new information on evolution of parasitism. The results were published in six impacted papers. Grant rules were satisfied.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2011

  • Realization period - end

    Apr 25, 2017

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    May 26, 2015

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP18-GA0-GA-U/02:1

  • Data delivery date

    May 4, 2018

Finance

  • Total approved costs

    9,106 thou. CZK

  • Public financial support

    9,106 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK