Identification and localization of protein complexes involved in the regulation of chlorophyll biosynthesis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-10-1000
Alternative language
Project name in Czech
Identifikace a lokalizace proteinových komplexů, které se podílejí na regulaci biosyntézy chlorofylu
Annotation in Czech
Chlorofyl (Chl) je spolu s hemem syntetizován v jediné větvené dráze, která musí být přesně regulovaná s ohledem na fototoxicitu metabolitů a velmi odlišnou potřebu hemu a Chl za různých růstových podmínek. K pochopení regulace takto komplexní metabolické dráhy bude nutné postoupit od statického modelu (šipkami propojené enzymatické přeměny) ke skutečné lokalizaci jednotlivých enzymů v buňce, identifikaci interagujících proteinů a proteinových komplexů. V tomto projektu budeme systematicky mapovat proteinové interakce enzymů syntézy Chl. Využijeme knihovnu kmenů sinice Synechocystis 6803, kde jsou jednotlivé enzymy této dráhy exprimovány s 3xFLAG kotvou. Tento přístup umožní a) purifikaci enzymů za nativních podmínek a identifikaci interagujících proteinů b) lokalizaci enzymů v rámci buňky a případnou identifikaci kompartment-specifických komplexů. V pozdější fázi projektu budou identifikované proteiny detailně charakterizovány pomocí biochemických a genetických metod s cílem objasnit jejich regulační funkci v syntéze Chl .
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
ED - Physiology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Project solution was focused on the analysis of protein-protein interactions in the chlorophyll biosynthetic pathway in model cyanobacterium Synechocystis and a progress in unravelling the mechanisms of chlorophyll metabolism regulation has been achieved. Results were published in 7 papers in high standard journals (4 in the top journals with IF > 5, 3x Plant Physiol, 1x Curr Opin Plant Biol).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 12, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
4,049 thou. CZK
Public financial support
4,049 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK