Fine Mapping and Candidate Gene Analysis of the Flowering Time Gene on Wheat
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-10-1778
Alternative language
Project name in Czech
Přesné mapování a identifikace kandidátního genu ovlivňujícího dobu kvetení pšenice
Annotation in Czech
Geny ovlivňující dobu kvetení u pšenice (Vrn, Ppd, Eps) hrají důležitou roli při adaptaci a ovlivňují výnos. Na pracovišti VÚRV byl geneticky mapován nový gen kvetení QFt.cri-3B.1 na dlouhém rameni chromosomu 3B v blízkosti SSR markeru Xbarc164. Navrhovaný projekt je zaměřen na podrobnější analýzu tohoto genu a zahrnuje přesné mapování jako předpoklad pro jeho klonování a studium jeho funkce a rovněž analýzu fenotypu s cílem charakterizovat vliv genu na růst a vývoj pšenice. Pro tzv. bin mapování budoupoužity chromosomové deleční linie; pro genetické mapování budou použity F2 populace odvozené z tzv. NIL linií; srovnávací analýzy budou prováděny s geonomy Brachypodia a rýže. Lokální kontig bude sestaven v oblasti genu s použitím fyzické mapy a BAC knihovny specifické pro chromosom 3B kultivaru Chinese Spring. Dále bude připravena nová BAC knihovna specifická pro chromosom 3B kultivaru Česká Přesívka a klony s kandidátními geny budou identifikovány a sekvenovány. Dlouhodobým cílem projektu je identifikace kandidátního genu pro QFt.cri-3B.1.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
GE - Plant cultivation
CEP - another secondary branch
DO - Protection of landscape
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10511 - Environmental sciences (social aspects to be 5.7)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Exact mapping of QFt.cri-3B.1 gene using mainly SNP markers was performed. It enables future cloning of this gene modulating flowering in wheat. Using generated wheat genotypes plant microphenology and fuction of this gene was studied. Work was publishedin two impact publications, review and book chapter. The goals were fullfilled, budget changes were substantiated.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 7, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
5,801 thou. CZK
Public financial support
5,801 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK