Cyanobacterium Nostoc as a genetic and functional model for the plant cytokinin hormone metabolism
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-12-0161
Alternative language
Project name in Czech
Sinice Nostoc jako genetický a funkční model pro metabolismus rostlinných hormonů cytokininů
Annotation in Czech
Aktuální publikace stejně jako naše předběžné výsledky ukazují, že sinice jsou schopny produkovat cytokininy, které jsou známé jako hormony u rostlin. V souvislosti se získáním kompletní genomové sekvence sinice Nostoc sp. PCC 7120 byly identifikovány geny kódující proteiny podobné enzymům zapojeným do biosyntézy a degradace cytokininů u rostlin, ale jejich funkce není zatím známa. Naším cílem je připravit tyto proteiny zahrnující isopentenyltransferasu, cytokinindehydrogenasu a hypotetický cytokininový receptor v heterologním hostitelském systému (E. coli, kvasinky, tabák) a prověřit jejich funkci pomocí měření enzymových aktivit, respektive pomocí cytokininového receptorového testu. Mimo to, bude analyzováno spektrum cytokininů produkovaných sinicí Nostoc za různých fyziologických podmínek a interpretováno ve vztahu k transkripčním profilům studovaných genů s cílem objasnit jejich fyziologickou funkci v sinicích.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project was focused on identification of genes involved in cytokinin biosynthesis, degradation and signalling in model cyanobacterium Nostoc sp. One biosynthetic gene produced free cytokinins, the second one prenylated tRNA. Degradation enzymes were not detected. Expression of receptor gene was dependent on cytokinin levels and light. The results include 3 papers in impacted journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Apr 23, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
11,000 thou. CZK
Public financial support
11,000 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK