Diversity and distribution of viruses across lichen species
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-12-1747
Alternative language
Project name in Czech
Diverzita a distribuce virů mezi lišejníky
Annotation in Czech
Lišejníky představují starobylou a velmi úspěšnou formu symbiotického organizmu. Hlavními komponentami lišejníků jsou zelené řasy nebo cyanobakterie spolu s houbou, často však doplňované sekundárními houbami a volně žijícími bakteriemi. Virové infekce volně žijících hub a řas jsou velmi časté, proto předpokládáme, že stejně časté budou i u lišejníků. Pro detekci RNA virů použijeme důkaz pomocí přítomnosti vysokomolekulární dsRNA, DNA viry budeme prokazovat amplifikací Phi29 DNA polymerázou. Viry budou identifikovány sekvenováním in-vitro připravených segmentů genomů. V některých případech budeme odděleně kultivovat fotobionta a mykobionta a pozorovat vliv přítomnosti viru na jejich valstnosti. Tyto kultury budou použity na purifikaci viru(ů) a přípravu protilátek. Molekulární detekce virů v hmyzu přítomném v místech výskytu lišejníků pomůže odhalit jejich případné hmyzí vektory.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
EH - Ecology - communities
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Project results proved lichens to host different plant viruses. Novel mycoviruses have been found and identified in analyzed lichens. Also mites have been recognized as putative vectors of mycoviruses. The mycoviruses did not cause detectable phenotypic changes of host lichenes. The project management was in accordance with the valid rules.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Apr 25, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
5,947 thou. CZK
Public financial support
5,947 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK