Chromosomal rearrangements with breakpoints in T cell receptor genes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P502-12-1966
Alternative language
Project name in Czech
Chromosomové přestavby s místy zlomů v genech pro T buněčné receptory
Annotation in Czech
Geny pro T buněčné receptory (TR) jsou během dozrávání T buněk přeskupovány místně specifickou rekombinací V(D)J segmentů. Příležitostně dochází k nelegitimním rekombinacím mezi různými TR geny, což vede ke vzniku reciprokých translokací nebo inverzí chromosomů. Přestavby TR genů s onkogeny jsou běžné u T buněčných malignit. Předpokládá se, že počet nelegitimních přestaveb s oběma místy zlomů v TR genech koreluje s rizikem vzniku lymfomu. Nelegitimní přestavby budou studovány v kultivovaných lymfocytechprasat, skotu, ovcí, koňů a myší metodou fluorescenční in situ hybridizace s malovacími sondami. Selektované hybridní geny budou charakterizovány pomocí PCR, elektroforézy a sekvenování. Procento γδ T buněk v lymfocytech periferní krve a v kulturách lymfocytů bude měřeno nepřímým imunofenotypováním a průtokovou cytometrií, abychom otestovali hypotézu, že frekvence nelegitimních přestaveb je vyšší u γδ T-buněk než u αβ T-buněk.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project assessed the frequencies of chromosomal rearrangements in TCR genes. The results were published in one publication comparing recombinations in pigs and humans, and in the second publication comparing Equidae family. Both publications were published in journals that do not reach a middle value for given subject category. It is pity that investigators do not aim better journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 19, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
May 22, 2015
Finance
Total approved costs
4,855 thou. CZK
Public financial support
4,855 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK