Interspecies comparison of nitrilases by using recombinant enzymes obtained by database-mining: their environmental impact and potential application
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P504-11-0394
Alternative language
Project name in Czech
Mezidruhová analýza rekombinantních nitrilas exprimovaných z hypotetických sekvencí, jejich význam a potenciální aplikace v životním prostředí
Annotation in Czech
Pouze malá část ze sekvenovaných nitrilas byla zkoumána z hlediska enzymové funkce. Exprese asi 25 syntetických genů kódujících hypotetické nitrilasy v houbách (hlavně fytopatogenních druzích) a biochemická charakterizace produktů jejich translace námumožní poprvé popsat funkci těchto enzymů. Roztřídíme je do skupin podle substrátové specifity a na základě kinetických dat budeme formulovat hypotézy o jejich přirozených substrátech. Vybrané nitrilasy lišící se v substrátové specifitě budou purifikovány a charakterizovány, pokud jde o jejich katalytické a strukturální vlastnosti. Budeme také exprimovat (v E. coli and Rhodococcus sp.) kolem pěti nitrilas z aktinobakterií a srovnáme jejich substrátovou specifitu a strukturální vlastnosti s fungálními nitrilasami. Vyhodnotíme schopnost fungálních a bakteriálních nitrilas transformovat benzonitrilové herbicidy a navrhneme mikroorganismy a enzymy vhodné k eliminaci těchto látek. Exprese reprezentativního souboru nitrilasových genů nám umožní vyhodnotitvliv chaperonů na expresi nitrilas a zjistit, zda se jedná o jev obecný nebo specifický pro určité enzymy.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
1. Created set of new nitrilasez were created, optimization of their production, new finding about their distribution in natural conditions. 2. Data given in report are appropriate. 3. results important in science, applied environmental research, education. 4. Publication output very good. 5. No imperfections found.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 23, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
May 22, 2015
Finance
Total approved costs
9,720 thou. CZK
Public financial support
9,720 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK