The control of flowering in Chenopodium investigated by the transcriptomic approach
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P506-12-1359
Alternative language
Project name in Czech
Regulace kvetení u rodu Chenopodium studovaná pomocí transkriptomiky
Annotation in Czech
Cílem projektu je pochopit genetické pozadí regulace kvetení u rodu Chenopodium na modelu Chenopodium rubrum. Projekt navazuje na předešlou studii zaměřenou na klíčové geny CrFTL1 aCrCOL, homologa FLOWERING LOCUS T a CONSTANS u Arabidopsis. Naše studie odhalily neobvyklý průběh exprese květního induktoru CrFTL1 u C. rubrum, odlišný od ostatních zkoumaných krátkodenních rostlin. Nyní navrhujeme identifikovat u C. rubrum další geny související s kvetením pomocí analýzy transkriptomu metodami sekvenování další generace. Dále chceme provést analýzu funkce nově nalezených genů pomocí genetické transformace C. rubrum. Role genů účastnících se regulace kvetení u C. rubrum bude zkoumána také u C. quinoa, důležité plodiny Jižní Ameriky.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project focused on transcriptom of Chenopodium rubrum was successfully fullfiled. All aims of the project were done and publish in the three papers and at least one is in the process. The results published in the highest quality journal were partly results of the previous project. The rules of the CSF were followed.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Sep 25, 2017
Finance
Total approved costs
5,662 thou. CZK
Public financial support
5,662 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK