Controlling structure and function of biomolecules at the molecular scale: theory meets experiment
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Projects for promotion of excellence in basic research
Call for proposals
Excelence v základním výzkumu 1 (SGA02012GA-GB)
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta<br>Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta<br>Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v. v. i.<br>Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P208-12-G016
Alternative language
Project name in Czech
Řízení struktury a funkce biomolekul na molekulové úrovni: souhra teorie a experimentu
Annotation in Czech
V předkládaném projektu je navržena nová metodologie řízení struktury a funkce biologických systémů na molekulové úrovni. Metodologie je založena na vývoji experimentálních a výpočetních metod pro kvantitativní popis nekovalentních interakcí ve velkých molekulových systémech. Uvedený přístup bude aplikován na systémy, ve kterých nekovalentní interakce hrají klíčovou roli při kontrole (kvazi)reverzibilních procesů pro následující vzájemně propojené systémy: i) interakce mezi proteiny a ligandy a in silico modelování ligandů s novými vlastnostmi, ii) interakce mezi proteiny a fosfo-lipidovými membránami ve vodných roztocích, které jsou důležité pro enzymatickou aktivitu a prostupnost membrán, iii) interakce proteinů, peptidů a malých farmaceuticky relevantních molekul s nanostrukturami uhlíku, které jsou potenciálními transportery léčiv. Tento mezioborový přístup vyžaduje propojení mezi výpočetní chemií, medicinální chemií, biochemií, organickou chemií a strukturální biologií.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Both the theoretical (ab-initio/DFT and MM level) and experimental (NMR, fluorescence spectroscopy, light scattering, …) methods were developed and utilized in the description and study of the structure and mutual interactions of biomolecules (focused to interactions of bilipid membranes with proteins/enzymes) or interactions of biomolecules with inorganic molecules (ions in solutions, graphene).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 25, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GB-U/02:1
Data delivery date
Feb 24, 2020
Finance
Total approved costs
114,429 thou. CZK
Public financial support
114,429 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK