Polyploidy generates beauty – exploration of complex genomes of roses (Rosa L. sect. Caninae (DC.) Ser.)
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
International projects
Call for proposals
Mezinárodní projekty 11 (SGA0201600003)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-02149J
Alternative language
Project name in Czech
Polyploidie a krása - analýza komplexních genomů růží (Rosa L. sect. Caninae (DC.) Ser.)
Annotation in Czech
Četné aspekty evoluce polyploidních druhů zůstávají přes značný pokrok v našich znalostech neobjasněné. Jedním z málo prozkoumaných systémů je ekologicky významný rod Rosa, jehož polyploidní zástupci se vyznačují unikátním průběhem meiózy, kdy se dědičný materiál distribuuje nerovnoměrně mezi samičí a samčí gamety. V předkládaném mezinárodním projektu navrhujeme pomocí moderních cytogenetických a genomických metod studovat tento asymetrický reprodukční systém u přirozených a umělých polyploidů sekce Caninae. V české laboratoři bude provedeno paralelní sekvenování genomů vybraných zástupců a na základě získaných dat budou pomocí genomických a molekulárně biologických přístupů izolovány chromosom-specifické sekvence DNA. Tyto sekvence budou využity německým partnerem jako sondy pro charakterizaci strukturních komponent bivalentních a bivalentních chromosomů s cílem objasnit jejich chování v mitóze a meióze. Předpokládáme, že výsledky přispějí k lepšímu porozumění neobvyklého matroklinního reprodukčnímu systému u růží a polyploidie obecně.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The international project aimed to thoroughly analyze the specific type of polyploidy associated with asymmetric meiosis in dogroses. Principal Investigator and his partner from the Gorlitz Museum (Germany) focused on the investigation of satellites and rDNA in dogroses. Long-term construction and maintenance of the databases of plant rDNA and B chromosomes was also related to this project.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GC-U/01:1
Data delivery date
Jun 27, 2019
Finance
Total approved costs
4,428 thou. CZK
Public financial support
4,233 thou. CZK
Other public sources
195 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK