Transcriptomics of Bordetella pertussis and human phagocytes interplay
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
16-34825L
Alternative language
Project name in Czech
Dual RNA-seq analýza genové exprese v průběhu infekce lidských makrofágů baktériemi Bordetella pertussis
Annotation in Czech
Bordetella pertussis je výlučně lidský patogen který je původcem černého kašle, vysoce nakažlivé respirační choroby, jejíž výskyt je v současné době na dramatickém vzestupu a to i v ekonomicky vyspělých zemích s vysokou proočkovaností. B. pertussis byla až donedávna považována za extracelulární patogen, který kolonizuje zejména epitel dýchacích cest. Současné poznatky ale naznačují, že ji lze zařadit mezi fakultativně intracelulární patogeny, neboť je schopna přežívat v lidských fagocytech in vitro. Cílem tohoto projektu je analyzovat paralelní změny v transkripčních profilech lidských makrofágů infikovaných B. pertussis. Pomocí tzv. dual RNA-seq technologie budeme sledovat jak změny v genové expresi v infikovaných hostitelských buňkách tak i změny v expresi v baktériích v průběhu infekce a adaptace na prostředí hostitele. Tento přístup nám umožní identifikovat jak faktory, které jsou součástí imunitní odpovědi a napomáhají k odstranění baktérií, tak i virulenční faktory, které umožnují buňkám B. pertussis přežít fagocytózu, uniknout imunitní odpovědi hostitele.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The final professional evaluation of the project was carried out on the basis of the LA partner agency.
Solution timeline
Realization period - beginning
Sep 30, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 26, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GF-U
Data delivery date
Feb 28, 2022
Finance
Total approved costs
6,942 thou. CZK
Public financial support
6,942 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK