The role of temperature in the origin and evolutionary success of Arabidopsis polyploids
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
22-29078K
Alternative language
Project name in Czech
Vliv teploty na tvorbu a evoluční úspěšnost polyploidů v rodě Arabidopsis
Annotation in Czech
Celogenomová duplikace (polyploidizace, WGD) je běžná makromutace ovlivňující diverzifikaci, adaptaci a zemědělství. WGD je globálně asociovaná s nízkými teplotami, ale není vyjasněno, zda chladné prostředí indukuje tvorbu polyploidů nebo spíše poskytuje příležitost pro jejich expanzi a adaptaci. V tomto projektu budeme testovat obě tyto hypotézy v přirozeném kontextu pomocí studia čtyř případů genomové duplikace ve vůdčím rostlinném modelu Arabidopsis. Kombinací analýz našich sběrů napříč Eurasií s manipulativními experimenty otestujeme vliv okolní teploty na rychlost tvorby neopolyploidů ve všech liniích. Integrací experimentů s populačně genomickým modelováním pak zjistíme, zda adaptace na chladné prostředí přispívá k úspěchu polyploidů. Tento mezioborový návrh bude postavený na komplementární expertíze obou týmů v experimentech, karyologii, genomice i nových metodách linked-read sekvenování DNA. Naše výsledky odhalí roli makromutací v adaptaci na výzvy prostředí a, z druhé strany, i roli stresujícího prostředí na četnost makromutací.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jul 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Mar 6, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GF-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
7,980 thou. CZK
Public financial support
7,980 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK