Biological code of knots – identification of knotted patterns in biomolecules via AI approach

Provider

Czech Science Foundation

Programme

—

Call for proposals

—

Main participants

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Contest type

M2 - International cooperation

Contract ID

23-04260L

Project name in Czech

Biologický kód uzlů – identifikace uzlových vzorů v biomolekulách pomocí AI metod

Annotation in Czech

Cílem tohoto projektu je porozumět uzlovým jevům v proteinech na základě přístupu umělé inteligence (AI) a vyvinout prostředky pro předpovídání de novo uzlových struktur proteinů. Rozsah projektu patří do oblasti základního výzkumu ve strukturní biologii. Je zaměřen na vztahy mezi sekvencí, strukturou a funkcí proteinů a na jeden z nejobtížnějších aspektů v této souvislosti, kterým je role netriviální topologie. Projekt je interdisciplinární povahy a zahrnuje aspekty teorie uzlů (odvětví matematiky), strojového učení, počítačových simulací, strukturní biologie a studií in vivo a in silico.

R&D category

ZV - Basic research

OECD FORD - main branch

10610 - Biophysics

OECD FORD - secondary branch

10102 - Applied mathematics

OECD FORD - another secondary branch

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

BD - Information theory<br>BO - Biophysics<br>EB - Genetics and molecular biology

Realization period - beginning

Jan 1, 2023

Realization period - end

Dec 31, 2025

Project status

K - Ending multi-year project

Latest support payment

Apr 9, 2024

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP25-GA0-GF-R

Data delivery date

Mar 14, 2025

Total approved costs

4,137 thou. CZK

Public financial support

4,137 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK