An unexplored face of auxin signaling - the MONOPTEROS MP11ir isoform for an auxin-independent gene expression regulation during somatic embryogenesis
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
25-14425L
Alternative language
Project name in Czech
Neprobádaná tvář auxinové signalizace - izoforma MONOPTEROS MP11ir regulující expresi genů nezávislou na auxinu během somatické embryogeneze
Annotation in Czech
Cílem projektu je odhalit regulační vztahy mezi transkripčním faktorem kódovaným MONOPTEROS (MP) a jím řízenými cílovými geny během procesu somatické embryogeneze (SE) závislé na auxinu u Arabidopsis. PB1 doména MP je nezbytná pro jeho transkripční represi při nízkých hladinách auxinu. Izoforma MP11ir vzniká alternativním sestřihem, který vede k vytvoření zkráceného proteinu MP bez domény PB1. Předběžné studie polského a českého týmu identifikovaly MP11ir během procesu SE v Arabidopsis. Tento výzkum zmapuje mechanismus působení MP11ir a MP během procesu SE vytvořením genetické sítě MP11ir/MP. Technikou greenCUT&RUN bude získán seznam genů podpřímou kontrolou MP11ir/MP filtrovaný pro jejich rozdílnou expresi během embryogenního přechodu bioinformatickou analýzou. Vybrané kandidátní geny budou funkčně popsány. Projekt identifikuje a charakterizuje nové geny s klíčovou úlohou v embryogenních přechodech přímo regulovaných MP11ir/MP a rozšíří znalosti o úloze izoforem ve vývoji rostlin.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10605 - Developmental biology
OECD FORD - secondary branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology<br>EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GF-R
Data delivery date
Mar 6, 2025
Finance
Total approved costs
8,423 thou. CZK
Public financial support
8,423 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK