Amphibian species diversification across sky-island and lowland rainforests in a spatial and ecological context: genome-wide and continental transect
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Junior Grants
Call for proposals
Juniorské granty 1 (SGA0201500002)
Main participants
Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
15-13415Y
Alternative language
Project name in Czech
Druhová diverzifikace obojživelníků v prostorovém a ekologickém kontextu horských a nížinných deštných lesů: transekt genomem a kontinentem
Annotation in Czech
Předkládaná studie kombinuje multidisciplinární techniky za využití fylogenomických dat, koalescenčních přístupů a GIS modelování ekologických nik. Tento kombinovaný přístup umožní zhodnotit, jak divergují populace obojživelníků a jak vznikají nové druhy v na biodiverzitu bohatých tropických lesích. Hlavním cílem je studovat genetickou variabilitu napříč genomem, aby bylo možno empiricky a rigorózně vyhodnotit kryptickou druhovou diverzitu s využitím populačně-genetické koalescenční teorie. Dalším cílem společně v kombinaci s environmentálními a ekologickými charakteristikami modelového systému je zhodnotit faktory, které mohou být hnací silou při vzniku a udržování genetických divergencí. Komparace tří odlišných lesních formací (dvě vzdálené horské oblasti a mezi nimi se rozkládající nížinný les), extrémních životních strategií a habitatů nám umožní obecnější vhled do speciačních procesů u tropických obojživelníků a potažmo obecně v tropech.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EG - Zoology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Project contributed considerably to a better understanding of the processes of species diversification of amphibians in tropical Africa. Results have been published in articles in good-quality journals. New methods, ddRADseq and analysis of sequence capture data, were successfully introduced to P.I.’s laboratory. Several students were actively involved in the project.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2015
Realization period - end
Nov 29, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 17, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GJ-U/01:1
Data delivery date
Jul 2, 2020
Finance
Total approved costs
4,801 thou. CZK
Public financial support
4,801 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK