Repeated adaptation in wild carnations: the role of shared genetic variation and novel mutations in convergent selection signatures in the genome
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
SGA0202300005
Main participants
Botanický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-05469O
Alternative language
Project name in Czech
Opakovaná adaptace u divokých hvozdíků: role sdílené genetické variability a nových mutací v konvergentní evoluci genomu
Annotation in Czech
Pochopení genomické podstaty adaptace je hlavní výzvou současné evoluční biologie. Podobné selekční tlaky prostředí vedoucí k opakované adaptaci napříč druhy pro to poskytují ideální modelový systém. I přes časté studie dokumentující genomickou konvergenci víme jen málo o jejich mechanismech a rozsahu mezi druhy. Konkrétně nám chybí zhodnocení relativního podílu sdílených vs nových genetických variant v opakované adaptaci. Využiji opakovanou adaptaci na podobné selekční tlaky řízené substrátem, jako je iontový stres a sucho, u dvou druhů rodu Dianthus, abych zhodnotila roli prostorově se měnící selekce v konvergentní adaptaci na náročné podmínky prostředí. Propojím své zkušenosti z populační genomiky rostlin s novými dovednostmi ve statistické genomice, eko-evo experimentech a funkčních přístupech získaných v mé hostitelské laboratoři na ETH Zurich. Inovativním přístupem budu identifikovat sdílenou genomickou podstatu adaptace na náročné půdy, a poskytnu tak důležité poznatky pro evoluční biologii, šlechtění plodin a ochranu rostlin.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Oct 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Oct 13, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GN-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
6,374 thou. CZK
Public financial support
6,374 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK